在行省逐渐成熟之后，下设的州县也渐渐铺开，并且和南衙各卫一样，逐渐与军府合并。
军府最早是各卫下属的征兵训练机构，由于紫帐汗国早年就没有专业的行政机关，所以军府与各卫一样，既管军，也管民。
最早，紫帐汗国的南衙兵，其实就是农庄卫队。汗廷命令各个农庄的居民，按比例登记“军户”。有些地方是八家，有些地方是十家，编成一组，每组供养一个军户。
汗廷的第一批武器，是找威尼斯奸商买的；第一批盔甲，是伯颜帖木儿跑去金帐汗廷，找月即别汗死皮赖脸求来的。随着屯垦规模扩大，投奔的人增加，这点武器装备根本不够用，大家只能自己想办法。
军户需要自备武器，所以理论上应该由组里最有钱的人充当。就像欧洲同行那样，骑士负责自备武器和战马，村民们则提供税收养活他。
问题是，紫帐当时那个情况，大家基本都差不多穷，组里的“富人”，其实条件也就那样，还是得靠乡亲们帮衬。大家你凑个胸甲，我凑把斧头，尽量堆起来一身。所以，有时候，干脆就不去选富户了，还不如组里自己选个最能打的，然后众人按条件给他凑装备。
当时，紫帐控制区连个铁矿都没有，什么金属物件都得买，却又没什么钱。还是当时的北帐牧民，在胆大的也先不花太师带领下，冒充金帐军队，骗了一支热那亚商船队，偷来好几船铁，这才有了起步的物资。
也是因为如此，“南北战争”的时候，虽然贵人们对立严重，但很多基层军官和士兵，却天天念叨“第一船铁”的情分，要求不追究对面被裹挟的普通人。毕竟，他们也确实多次并肩战斗过。
等到汗廷打赢了几场仗，吞并了一些周围小贵族，物资也充足了些，这种介于元明军户和东罗马农兵之间的制度，就显得不太够用了。
汗廷希望组织起更多的士兵加入战争，至少也要接受训练，能够在精锐士兵出征后自保。于是，李天英、李天策兄弟，受命进行改革，模仿古代制度，逐渐废除了军户和农户之间的区别，代以通用的“国人”身份，希腊人则称之为“公民”。后来，由于大多数士兵都是当地人，后者成了正式的称呼。
这些公民士兵，平时都在庄园里劳作，战时就组织起来，按需求抽调人员出战，其余人则负责防卫和照顾农庄。理论上，一百户人家组成一个庄园，自己选举出一名百户长，一般也可以简称百户。
战时的人员编排、战利品的分配、平时的劳动协作，都以这种百户为单位，在百户长的主持下，由庄园公民自己安排。由于征战频繁，很多时候，也会有一名助理百户，负责轮流在对方不在时，维持庄园的管理。
紫帐汗国的军事压力很大，开垦和耕种的劳作强度也同样不低，所以，庄园内的居民必须通力协作。
如果有人在其他人出征时，不好好照顾人家的田地，下次就很难再找到人出征；如果有人在自己应征时，不信任留守的同伴，那军心也很难保证。而这样的结果，很明显都会影响军队的战斗力。