战斗就这么结束了，之后便是收尾的部分了。事实上很快的就有军方的部队冲进了神盾局的总部。空天航母的事情总统已经知道了，而尼克弗瑞的行动当然也和他说明了，总统这边当然也有准备。
之前空天航母开始升空的时候，总统已经让军队这边开始行动了，之前是因为担心对方发现所以没动，但是现在明显尼克弗瑞秘密行动失败，所以他们必须马上行动，于是总统下令军方开始攻击，务必拦下三艘空天航母。
不过军方这边也没来得及，这三艘航母自己就炸了。之后很快的军队也是冲进了神盾局的总部，控制了剩下的那些特工和部队，不管是不是九头蛇的人，反正都先抓起来再说。
其实现在还在地面上的特工基本上都不是九头蛇的人了，空天航母上的那些才基本上都是九头蛇的人，皮尔斯必须保证空天航母在自己的控制中，所以不可能放不是自己的人上去，不然内部出现问题怎么办，所以航母上的人都是九头蛇的成员，当然现在他们也伴随着航母的爆炸全部都死亡了，而地面的人虽然也有不少九头蛇的人，但是剩下的大部分都是不知道怎么回事的神盾局特工。
对他们来说皮尔斯是他们的局长，他们听从局长的命令办事，也不知道目前到底是怎么回事，军队的人这么就来了。不过军队这边带着总统的命令，他们能怎么办，也只能投降了。
局面很快就被控制住了，不管是皮尔斯还是交叉骨全部都被逮捕了，几个想要锤死挣扎的九头蛇士兵也被当场击毙，当然也有准备继续潜伏混在神盾局被抓的人里面的，不过到时候也都会被一一审问。
洞察计划的事情到这边本来就已经告于段落了，然而很快的，头痛的人就变成了总统这边。是的让他们没想到的是，这边的娜塔莎居然在军队到达之前，把神盾局的很多内部资料发送到了网络上，以至于一部分政府机密的资料被公开了，当然大部分都是神盾局的内部资料。
作为一个特务机关，他们做过的不能公开的事情可不少，这部分资料总统当然也不希望公开，不然只会引起民众的猜疑和不信任，这件事可不是尼克弗瑞之前和他们说好的。总统也很意外，因为尼克弗瑞和娜塔莎公开的资料对他们自己也非常的不利，他都想不通为什么两人要这么做。
然而对此，娜塔莎的解释就是，神盾局不应该继续存在下去了，这是队长的命令。
当然这也是之前制定计划的时候几人讨论过的事情，简单的说就是破而后立，现在的神盾局已经被九头蛇完全渗透殆尽，就算这次歼灭了大量的九头蛇成员，但是谁又能保证重建之后会不会被再次渗透，很明显这个组织是否要继续存在也成了疑问，队长的意见就是，让神盾局成为历史吧。
尼克弗瑞一开始也是不同意的，毕竟神盾局也算是他的心血，然而最后他还是被说服了。所以他们也没和总统汇报这件事，直接公开了资料，等于说直接毁了神盾局。
总统确实有些生气，但是木已成舟，现在也没什么办法了。本来他准备通过这次的事情，直接回收神盾局过大的权利，准备成立一个通过政府监管的新神盾局的，但是现在已经不可能了。那神盾局就成了最好的背锅对象，大部分的责任都能直接甩到神盾局的头上，然后直接宣布神盾局解散，所有人员就地免职，接受调查。
当然不管政府方面是怎么想的，林顿他们很明显是不准备配合的，事实上面对目前的情况，政府这边也有些不知道怎么办。这个世界已经发生了变化，他们明显要面对更多类似的威胁，来自特殊人群，甚至外太空的入侵，他们确实需要一直应对的小队，复仇者计划再次被提上了国会。
然而这个组织怎么运作，算是什么类型的组织，政府要不要参与，这些都成了国会争论的焦点。国会再次吵的天翻地覆，不过这并不关林顿他们什么事，此时林顿也是刚刚从医院回来，再次回到了托尼家里。
林顿去医院也是为了探望下队长而已，之前林顿也是让队长自己解决和巴基的问题，把两人传送到了地面上。两人则是继续展开了战斗，然而结果却是巴基这边获得了胜利。队长的战斗能力虽然很强，但是面对巴基实在是处处留情，施展不开，被对方击败，然而巴基这边居然最后也没有下杀手，而是放过了队长，之后便离开了，目前还没被抓到。